В Кыргызстане управление водными ресурсами для обеспечения надежного снабжения является серьезной проблемой. Наряду с выработкой энергии водные ресурсы используются для ирригации, промышленного и бытового водоснабжения.
Многие из этих видов использования создают нагрузку на водные ресурсы, и поддержание водной безопасности является ключевым приоритетом для сельского малоимущего населения23, большая часть которого занята в сельскохозяйственном секторе.
Водное хозяйство определено как наиболее уязвимый сектор для изменения климата в Кыргызской Республике. Воздействие изменения климата на водное хозяйство, как ожидается, будет иметь многочисленные негативные последствия для ряда секторов. В связи с этим, данный сектор признан в «Приоритетных направлениях по адаптации к изменению климата в Кыргызской Республике до 2017 года» одним из приоритетов в области адаптации в стране.
Повышение среднегодовой температуры повлияет на ледниковый покров и сопутствующий сток поверхностной воды, что, в свою очередь, затронет другие сектора, такие как сельское хозяйство, энергетика и муниципальное водоснабжение. Последствиями этого станут уменьшение поверхностного стока воды и существенное влияние на его внутригодовое распределение, например, уменьшение летнего максимального стока и его сдвиг на более ранний период в году. Крайне важен тот факт, что сроки наступления «переломного момента» (максимального расхода воды) в ледниковом стоке остаются неизвестными. Возможно, он уже наступил в Кыргызской Республике (т.е., сток уже может уменьшаться), или может наступить в ближайшие несколько десятилетий, или в более позднем периоде столетия. Согласно Третьему национальному сообщению (ТНС) (2016 г.), при пессимистичном сценарии изменения климата сценарий RCP8.5 и ежегодное уменьшение объема осадков на 5%) сток может уменьшиться примерно на 40%. Сельское хозяйство, в котором в целях ирригации используется 92-96% всей воды, относится к секторам, подверженным наибольшему риску, с последующим влиянием на здравоохранение, продовольственную безопасность и народное хозяйство.
Продолжающееся таяние ледников и уменьшение таяния снега, как ожидается, усилят трансграничную напряженность в области водных и энергетических ресурсов в Центральной Азии. Ключевые речные бассейны в Центральной Азии, такие как Амударья и Сырдарья, имеют большое значение для экономических систем многих стран, поскольку они снабжают водой обширные пространства пахотных земель и вырабатывают большую часть внутренней электроэнергии в виде гидроэлектроэнергии.
В настоящее время отмечается противоречие между летними ирригационными потребностями стран в нижнем течении (Казахстан, Туркменистан и Узбекистан) и зимними энергетическими потребностями стран в верхнем течении (Афганистан, Кыргызская Республика и Таджикистан). Торговля с другими государствами Центральной Азии связана с соглашениями о попусках воды, и любое климатическое воздействие на водные ресурсы также может затронуть торговые связи и соглашения между Кыргызской Республикой и ее соседями.